HXD3C型电力机车主变压器油冷却和牵引变流器水冷却使用水冷却器。采用这种“复合冷却”技术，使机车主要部件减少，缩减了油、水联接管路，减小了流阻，提高了冷却性能，减轻了重量，使得机车总体设计更加合理。