甲完成了一项发明，约定以20万元将专利申请权转让给乙公司，该合同由国家知识产权局进行登记并以公告。该发明被授予专利权后，乙公司发现丙公司早已持有该技术，并且一直用于生产某产品。经调查，甲公司在转让专利申请权之前，曾经与丙公司签订过技术秘密转让协议，允许丙公司一般使用该技术秘密。乙公司起诉甲、丙公司侵犯专利权。请问：甲公司的行为应如何认定？