屏障环境设施内动物饮水的灭菌小规模通常在普通自来水中加入次氯酸钠；另一种水的处理方法是在水中加入盐酸；第三种方法是用多孔的5μm、1μm陶器过滤器做两次过滤；第四种方法是用紫外线照射，为了达到良好的灭菌效果，许多动物室常将两种方法结合起来使用。