会计核算软件的功能模块以账务处理程序为核心连接在一起，构成一个完整的会计核算系统，但由于企业所属行业以及会计核算和管理需求不同，模块划分各有特点。对税务稽查而言，稽查人员需要重点关注的模块主要是账务处理、往来核算、工资核算、固定资产核算、存货核算、销售核算、成本核算、会计报表汇总等模块。