简述PCR反应体系,实验中注意的问题。
正确答案:1.PCR原理:PCR是利用DNA合成的原理,合成两个与靶DNA两侧序列互补的引物,在体外进行靶DNA的重复合成。
包括3个步骤:
(1)DNA变性:加热使靶DNA双链解离成两条单链。
(2)引物与靶DNA退火:降低温度至适当水平,促使两个引物根据碱基互补的原理分别结合至靶DNA的两条链的3’末端。
(3)引物延伸:在DNA聚合酶催化下,引物沿着靶DNA3’末端向5’末端延伸(引物延伸是5’→3’方向)。新合成DNA在新一轮变性解离后形成更多的模版与引物退火,在DNA聚合酶催化行,合成新一轮的靶DNA。每一轮DNA的合成均以所有DNA为模版,靶DNA数量呈指数增加。
2.注意问题:引物
(1)引物长度:15~30bp,常用为20bp
(2)引物扩增跨度:以200~500bp为宜,特点条件下课扩增至10kb
(3)引物碱基:G+C含量以40~60%为宜,太少扩增效果不佳,太多易出血非特异性条带;ATGC最后随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸成串排列
(4)避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异性扩增条带
(5)引物3’末端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对
(6)引物中有货最好加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点
(7)引物特异性:引物与核苷酸序列数据库的其他序列无明显同源性
(8)引物量: 每条引物浓度0.1~1μmol或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,过高引起错配和非特异性扩增,增加引物之间形成聚体的机会
P.CR循环次数:循环次数觉得PCR扩增程度。主要取决于模版DNA的浓度。一般的循环次数在30~40次,次数越多,非特异性产物量亦随之增多
设立对照:PCR反应应设立阳性和阴性对照,是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合理的一个重要参考指标。
包括3个步骤:
(1)DNA变性:加热使靶DNA双链解离成两条单链。
(2)引物与靶DNA退火:降低温度至适当水平,促使两个引物根据碱基互补的原理分别结合至靶DNA的两条链的3’末端。
(3)引物延伸:在DNA聚合酶催化下,引物沿着靶DNA3’末端向5’末端延伸(引物延伸是5’→3’方向)。新合成DNA在新一轮变性解离后形成更多的模版与引物退火,在DNA聚合酶催化行,合成新一轮的靶DNA。每一轮DNA的合成均以所有DNA为模版,靶DNA数量呈指数增加。
2.注意问题:引物
(1)引物长度:15~30bp,常用为20bp
(2)引物扩增跨度:以200~500bp为宜,特点条件下课扩增至10kb
(3)引物碱基:G+C含量以40~60%为宜,太少扩增效果不佳,太多易出血非特异性条带;ATGC最后随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸成串排列
(4)避免引物内部出现二级结构,避免两条引物间互补,否则会形成引物二聚体,产生非特异性扩增条带
(5)引物3’末端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对
(6)引物中有货最好加上合适的酶切位点,被扩增的靶序列最好有适宜的酶切位点
(7)引物特异性:引物与核苷酸序列数据库的其他序列无明显同源性
(8)引物量: 每条引物浓度0.1~1μmol或10~100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,过高引起错配和非特异性扩增,增加引物之间形成聚体的机会
P.CR循环次数:循环次数觉得PCR扩增程度。主要取决于模版DNA的浓度。一般的循环次数在30~40次,次数越多,非特异性产物量亦随之增多
设立对照:PCR反应应设立阳性和阴性对照,是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合理的一个重要参考指标。
答案解析:有

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